Ngày 29-9-2006, Thủ tướng Nguyễn Tấn Dũng đã ký Quyết định số 1288/QĐ - TTg về việc điều chỉnh phân công người đứng đầu các tổ chức tư vấn, phối hợp liên ngành do Thủ tướng Chính phủ thành lập.
Thủ tướng Nguyễn Tấn Dũng làm Trưởng ban Ban Chỉ đạo Quốc gia Dự án phóng vệ tinh viễn thông của Việt Nam được thành lập theo Quyết định số 989/QĐ - TTg ngày 1/9/2003 của Thủ tướng Chình phủ;

Phó Thủ tướng Nguyễn Sinh Hùng làm Trưởng ban Ban Chỉ đạo thực hiện Chương trình giảm nghèo và Chương trình 135 giai đoạn 2006 - 2010 theo Nghị quyết số 10/2005/NQ - CP ngày 5/9/2005 của Chính phủ;
Phó Thủ tướng Phạm Gia Khiêm làm Trưởng ban Ban Chỉ đạo nhà nước điều tra cơ bản tài nguyên môi trường biển được thành lập theo Quyết định số 889/QĐ - TTg ngày 6/6/2006 của Thủ tướng Chính phủ thay Phó Thủ tướng Nguyễn Sinh Hùng.